Thèses de Doctorat "Biotechnologie"

URI permanent de cette collection

https://dspace.univ-oran1.dz/handle/123456789/59

Parcourir par

Voici les éléments 1 - 20 sur 66

Effets inhibiteurs des bactéries lactiques : Bactériocines de lactoccus et d'enterococcus : mise en évidence d'un support plasmidique
(2006-07-01) DALACHE Fatiha
Nous avons étudié les interactions négatives interbactériennes chez 75 souches lactiques. Nous avons noté 53 % d'inhibition entre bactéries lactiques en milieu solide et 55 % en milieu liquide. 70 % de ces inhibitions étaient dues à l'acidité, 12 % au peroxyde d'hydrogène, 9 % à l'épuisement en nutriments et 4 % à la production des bactériocines. Les bactéries lactiques ont par ailleurs provoqué 73,5 % d'inhibitions chez des bactéries pathogènes et d'altération. Nous avons montré que trois souches lactiques sont productrices de bactériocines, deux de classe I ou II que nous avons appelées lactocine TF18 et lactocine V1.3, la dernière semblant être de classe III (entéricine LA).Par curage génétique nous avons montré que le gène (ou le groupe de gènes) codant pour la lactocine V1.3 est porté sur un plasmide d'un poids moléculaire supérieur à 23 kpb.
Contribution à la caractérisation chromosomique d'un panel d'hybrides somatique hamster-mouton et d'un panel d'hybrides d'irridiation hamster-mouton par PCR
(Université Oran1 Ahmed Ben Bella, 2006-12-20) BELHADJ KACEM TABET- AOUL Nacéra
L’Analyse des génomes des animaux domestiques est basée sur l’établissement des cartes chromosomiques, génétiques et physiques. La cartographie des génomes des ruminants, en particulier les bovins, ovins et caprins, a largement bénéficié des progrès réalisés chez les deux espèces les plus étudiées : l’homme et la souris. Les programmes de cartographie chez les bovins et les ovins ont, comme objectifs, l’identification des marqueurs QTL (Quantitative Trait Loci) et des gènes d’intérêt économique. La démarche utilisée est d’enrichir des régions chromosomiques en marqueurs anonymes en utilisant les données de la cartographie comparée. En effet, la grande homologie cytogénétique et génétique existant entre ces espèces de ruminants a facilité et a largement contribué à l’enrichissement de ces régions d’intérêt. Dans ce cadre, les panels d’hybrides somatiques et d’hybrides d’irradiation constituent des outils de cartographie simple et rapide permettant de réaliser cette démarche. Le but de notre étude est, d’une part, de poursuivre la caractérisation du panel de 24 hybrides somatiques hamster-mouton par l’analyse de 53 marqueurs microsatellites choisis à partir des cartes ovines et bovines et étudiés par amplification in vitro de l’ADN (PCR). Parmi ces marqueurs, 30 microsatellites ont été retenus. L’analyse de leur ségrégation dans ce panel d’hybrides a permis de mettre en évidence 18 nouvelles localisations chromosomiques ovines, 11 nouvelles cassures touchant 6 chromosomes ovins,le rallongement de 11 fragments préexistants et enfin l’enrichissement de la carte des autres chromosomes. D’autre part, nous avons contribué à la caractérisation du premier panel de 90 hybrides d’irradiation ovin à 12.000 rads, obtenu par le laboratoire de génétique biochimique et de cytogénétique à l’INRA de Jouy-en-Josas (France), par l’analyse d’une région du bras q du chromosome ovin OAR1 en utilisant 20 microsatellites bovins. Parmi ces derniers, 13 marqueurs ont donné de bons résultats d’amplification dans ces hybrides. L’ensemble des résultats obtenus a été introduit dans le Logiciel Carthagène afin de déterminer les groupes de liaison. L’analyse « deux points » a mis en évidence 9 groupes dont 7 possèdent chacun un marqueur et 2 comportent respectivement 2 et 4 marqueurs. L’analyse « multipoints » a permis d’ordonner les marqueurs et d’établir les distances pour chaque groupe qui sont respectivement de 25.6cR et 158.7cR.Grâce à une meilleure connaissance de l’organisation du génome ovin par la détermination et la localisation des gènes d’intérêt ainsi que l’enrichissement de ces régions en marqueurs polymorphes anonymes, diverses applications pourraient être envisagées, à moyen et long terme, par la mise en place de programmes de sélection pour l’amélioration des races ovines en général et des races ovines algériennes en particulier.
Protéolyse chez lactobacillus purification et caractérisation de protéases et aminopeptidase
(Université Oran1 Ahmed Ben Bella, 2010-11-08) Roudj Salima
Nous avons étudié l'activité protéolytique chez les deux lactobacilles BH14 et CHTD27 isolés de lait de chamelle. Les deux bactéries ont montré l'aptitude à la protéolyse des caséines du lait ou des caséines en solution et celle de produire des protéases dans le milieu de croissance. Nous avons observé que les protéases liées à la paroi bactérienne ne sont pas libérées parautoprotéolyse mais qu'elles y sont ancrées par covalence. L'étude des protéases extracellulaires a montré que celles-ci sont des métallo-enzymes et leurs activités sont différemment sensibles aux ions. La spécificité de l'hydrolyse des caséines (α, β, k) dépend de la souche. Les protéases de la souche BH14 sont actives à pH acide (4,0-5,0) ainsi qu'à pH alcalin (8, 0). Nous avons montré que les profils peptidiques distincts. Aucun mutant protéolyse-déficient (Prt-) n'a pu être obtenu après mutagenèse aux rayons UV ou par curage d'ADN plasmidique, ce qui indique que les gènes impliqués doivent être portés par le chromosome chez BH14 et CHTD27. Les deux bactéries ont montré une activité leucyl-aminopeptidasique sur le substrat chromogène leucylparanitroanilide. L'enzyme extraite après traitement glycine/lysozyme et purification par chromatographie (Sephadex G100 et DEAE) et par électrophorèse SDS-PAGE a montré une structure dimérique. L'activité de l'enzymeleucyl-aminopeptidase de la bactérie CHTD27 est sensible à l'EDTA et elle est fortement inhibée par les ions Cu2+. Chez BH14, l'enzyme est sensible à l'EDTA et au PMSF ; par contre elle est augmentée par les ions Na+ et Co2+. Les deux bactéries ont montré une activité autolytique induite élevée. La cytométrie en flux, associée à la microscopie à fluorescence, a montré que plus de 50% des cellules de la souche BH14, cultivées en fermenteur jusqu'à la phase stationnaire de croissance, restent viables durant au moins 120 heures.
Analyse physiologique, génétique et moléculaire de lactocoques issus du lait cru de chamelle d’Algérie
(Université oran1 Ahmed Ben Bella, 2011-02-10) DRICI Habiba
Le Lait de chamelle est un écosystème bactérien très peu exploré dont nous avons isolé 180 souches protéolytiques, capables d'hydrolyser les caséines du lait. Cinq isolats avec une forte activité protéolytique et capables de fermenter le citrate ont été identifiés à Lactococcus lactis subsp. lactis biovar diacetylactis. Ces lactocoques possèdent au moins 3 plasmides (pPRT, pLAC, pCIT) qui portent respectivement les gènes codant pour la protéase de surface PrtP (prtP) responsable de l'hydrolyse des caséines du lait, le métabolisme du lactose (lac) et du citrate (cit). Chez 3 isolats, au lieu de l'opéron citQRP habituel des biovariants diacetylactis, le cluster citI-citMCDEFGRP a été acquis d'autres bactéries lactiques (Leuconostoc). L'originalité de l'isolat 9B réside aussi dans sa capacité à se développer à 50°C et à une spécificité d'hydrolyse des caséines différente de celles des PrtPs de type PI et PIII des lactocoques laitiers actuellement connus. Cette spécificité nouvelle (type P IV) pourrait s'expliquer par la présence de nombreuses substitutions parmi les 1775 acides aminés de la protease mature. Cette étude a mis en évidence la diversité génétique des lactocoques issus dulait de chamelle qui se traduit par de nouvelles propriétés intéressantes pour l'industrie laitière
Mise en évidence de Helicobacter pylori à partir des biopsies gastriques et son antagonisme avec les lactobacilles
(Université oran1 Ahmed Ben Bella, 2011-06-30) MEDOUAKH Lynda
Le But de ce présent travail est de détecter in vitro le pouvoir inhibiteur des souches de Lactobacilles isolés du lait de chèvre sur la bactérie pathogène de H. pylori isolée des biopsies gastriques et de déterminer l'agent inhibiteur. En premier temps, la recherche de H. pylori a été réalisé à partir des biopsies gastriques des patients atteints de maladies gastroduodénales (gastrite chronique, ulcére gastroduodénale), et ayant subi une endoscopie digestive haute. La présence de cette bactérie a été mise en évidence par des tests invasifs : test rapide à l'uréase, l'examen cytologique, l'examen histologique, la culture et l'amplification génique PCR en temps réel.L'identification des souches de H. pylori isolées a été basée sur les caractères morphologiques (macroscopique et microscopique) et biochimiques (test à l'uréase, test à l'oxydase et la catalase).Nous avons pu isoler trois souches de H. pylori alors que les autres tests invasifs utilisés montrent parfois la présence de H. pylori dans les échantillons présentant une négativité de la culture (résultat faussement négatif). Ceci est probablement du à l'erreur de l'échantillonnage ou la sensibilité de la culture. Par ailleurs, l'étude de la sensibilité des souches de H. pylori aux antibiotiques habituellement utilisés dans le choix thérapeutique a montré l'excellente activité de la plupart des antibiotiques testés vis-à-vis de H. pylori. Aucune résistance à la clarithromycine n'a été observée chez toutes les souches de H. pylori, cette résistance constitue le facteur majeur d'échec du traitement d'éradication de H. pylori. De plus, La technique moléculaire de la PCR en temps réel a permis de détecter à la fois H.pylori et d'éventuelle mutation de résistance à la clarithromycine à partir des biopsies gastriques ou de la colonie. En effet, les souches isolées de H. pylori (HP1, HP2, HP3), traitées par cette technique ont révélé d'une part leur conformité à l'Helicobacter pylori (ADN positif). Elles sont identifiées comme des souches dites sauvages (Wite type), et d'autre part, montre que ces souches ne présentent aucune mutation de résistance à la clarithromycine En second temps, 42 souches de lactobacilles ont été isolés à partir du lait cru de chèvre, et identifiés en se basant sur des critères morpholologiques,biochimiques et physiologiques. Les souches lactiques sont rattachées aux 3 groupes (I, II, III). Par ailleurs, cette identification a révélé la présence d'une diversité en espéces dans le genre de lactobacilles répartie essentiellement entre Lb. delbrueckii (sp. bulgaricus et sp. lactis ); Lb. helveticus; Lb. salivarius ; Lb. plantarum ; Lb. casei (sp. casei et sp. rahmnosus) ; Lb. rhamnosus ; Lb.paracasei ; Lb. pentosus ; Lb. brevis et Lb. fermentum. D'autre part, nous avons testé l'activité antimicrobienne in vitro des lactobacilles isolés ainsi que la souche de référence vis-à-vis des souches isolés de H. pylori (HP1, HP2, HP3) et les souches de référence (HP4) et (HP5) par la méthode directe de diffusion (Geis et al., 1983).Les souches de Lactobacillus sp. ont présenté dans l'ensemble une activité antagoniste vis-àvis de H. pylori, démontrée par l'apparition de zone d'inhibition avec des diamètres variés d'une souche à l'autre. La souche de Lb. rhamnosus (LBR1) a prouvé un pouvoir inhibiteur le plus élevé dont le diamètre d'inhibition est de 19 mm. L'évaluation du pouvoir acidifiant chez les 14 souches sélectionnés pour leur pouvoir inhibiteur élevé a été réalisée par la mesure du degré Dornic. Les espèces ayant un pouvoir acidifiant élevé sont: Lb. rhamnosus (LBR1) avec 69 D°, Lb. delbrukii sp. Bulgaricus (LBDB1, LBDB3) et Lb. plantarum (LBP1) avec une acidité de 65 D°. La recherche de la nature de l'agent inhibiteur chez les 14 souches de lactobacilles par la méthode indirecte des puits a révélé que la production d'acide lactique est le facteur responsable de l'inhibition de H. pylori chez la majorité des lactobacilles testés. Tandis que chez la souche Lb. brevis, l'agent inhibiteur est l'acide lactique et une autre substance indéterminé, qui n'est pas une bactériocine, ni peroxude d'hydrogéne. Par ailleurs, l'étude de la viabilité de H. pylori en milieu liquide en présence de surnageant de la souche Lb. rhamnosus1, selectionné pour son pouvoir inhibiteur élevé, et de l'acide lactique a confirmé l'effet inhibiteur de l'acide lactique sur la croissance de H. pylori. Enfin, nous avons testé le pouvoir inhibiteur de nos souches lactiques vis-à-vis des bactéries pathogènes Gram positive (St aureus, B. subtilis) et bactéries gram négatives (E. coli, Kb. Pneumoniae, S.entertidis, Ps. aeruginosa). Les souches de lactobacilles testées exercent également une activité antimicrobienne contre les bactéries pathogènes et présentent un spectre d'activité large renfermant les bactéries Gram positive et les bactéries Gram négative montrant ainsi la capacité des lactobacilles à inhiber des bactéries pathogène en générale et l'Helicobacter pylori en
Diversité taxonomique et symbiotique des rhizobia associés aux Acacia sp. d’Algérie
(2012-06-13) Boukhatem épouse Benhamadi Zineb-Faiza
La diversité des rhizobia associée avec les Acacias natifs et introduits en Algérie a été étudiée à partir de sols prélevées de sept Wilayas de zones arides et semi arides. La tolérance in vitro des souches rhizobiennes au NaCl et aux hautes températures sur milieux de culture varient largement sans aucune relation avec l’origine géographique de leurs plantes hôtes. Il n’y a aucune corrélation avec les caractéristiques edaphoclimatiques du site d’échantillonnage comme cela a été démontré par l’analyse de la composante principale. Basée sur la comparaison des séquences du gène 16S rARN, 48 nouvelles souches représentatives de la diversité de notre collection ont été classées dans 10 groupes phylogénétiques représentant cinq genres bactériens : Ensifer, Mesorhizobium, Rhizobium, Bradyrhizobium, et Ochrobactrum. Une espèce introduite Acacia saligna semble avoir le spectre d’hôte le plus large, elle est nodulée de façon efficiente avec la diversité la plus importante des taxa rhizobiens incluant les souches à croissance rapide : Rhizobium, Ensifer, et Mesorhizobium et celles à croissance lente Bradyrhizobium. Les cinq autres espèces d’Acacias sont associées exclusivement avec les souches à croissance rapide. Il n y a pas de différence d’efficience entre les taxa bactériens isolés d’une espèce donnée d’Acacia. La fixation d’azote évaluée par la dilution isotopique et l’abondance naturelle du 15N est plus élevée chez A.saligna, comparativement à A.karroo et A.seyal, ce qui encourage l’utilisation de cette espèce comme espèce pionnière dans les programmes de réhabilitation des sites dégradées.
Etude du stress osmotique chez des lactocoques isolés de lait de chamelle de Timimoun
(2012-12-19) Boublenza Faiza
Nous avons étudié l’effet du stress osmotique sur des lactocoques de la collection du laboratoire et qui proviennent du lait de chamelle de la région de Timimoun (Sud Ouest algérien). Le suivi de la croissance de 20 souches en présence de différentes concentrations de NaCl(1.1 ,1.2 ,1.4,1.6 et1.7M) dans le milieu M17 a montré que ces souches pouvaient croitre dans un milieu salé d’une concentration allons jusqu'à 1.6M .L’un des paramètres étudié dans ce travail est la survie des souches face à des concentrations croissantes de NaCl jusqu'à aboutir à la CMI(concentration minimale inhibitrice). L’étude de l’osmoprotection par la proline et la glycine betaine a montrée que les deux molécules apportent une osmoprotection en présence de la CMI de NaCl ; la proline été sélectionné comme l’osmoprotecteur le plus efficace pour ces souches à une concentration de 70mM, la cinétique de croissance des souches dans les différentes conditions a confirmée ces résultats. L’activité acidifiante des souches est affecté par ce stress après culture en fermenteur, cette activité étant la principale activité métabolique de ces bactéries qui caractérise aussi leur l’état physiologique. Dans la deuxième partie de la thèse, nous avons sectionné deux souches (CHT1 et CHT4) pour mettre en évidence l’un des mécanisme de lutte contre ce stress qui est la synthèse de protéine chaperonne par l’électrophorèse SDS-PAGE, les résultats montrent que le sel induit des modifications qualitatives et quantitatives dans la synthèse protéique, les profils protéiques ont été analysés par un logiciel (image j) qui nous a permis de mettre en évidence les différences entre les profils selon le temps d’incubation des cellules dans les différentes concentrations de NaCl (24h,48h et72h) ; le deuxième mécanisme qui a été mis en évidence est l’accumulation de la proline dans les conditions de stress par chromatographie en couche mince et quantifié par un dosage spectrophotométrique. Par ailleurs, une comparaison du profil plasmidique des deux souches suggère que le contenu en ADN plasmidique est susceptible de subir des variations qualitatives en fonction de la concentration saline. Sur la base de la cytométrie en flux et les résultats obtenus avec le double marquage par c FDA et PI a bien quantifié l’hétérogénéité physiologique dans la population des bactéries lactique testées. Par conséquent, on peut conclure que la cytométrie en flux multiparamétrique était un outil excellent pour l'évaluation rapide de la viabilité cellulaire après exposition au stress osmotique. L’observation de l’état physiologique des cellules sous microscope à fluorescence, a permis de déduire que les cellules stressées sont rassemblées en agrégats avec une association en chainettes, ceci représente une caractérisation morphologique des bactéries stressées.
La rayure réticulée de l’orge (Hordeum vulgare L.) dans le Nord-Ouest Algérie : importance, morphologie et pouvoir pathogène chez Pyrenophora teres f. teres et recherche de moyens de lutte
(Université oran1 Ahmed Ben Bella, 2013-06-13) Boungab Karima
La culture de l'orge joue un rôle important dans l’équilibre de l’économie algérienne. Les prospections effectuées au niveau de trois zones agroclimatiques différentes situées dans le nord-ouest algérien ont révélé la présence de nombreuses maladies cryptogamiques chez l’orge dont les plus importantes en incidence et en sévérité sont la rayure réticulée, la strie foliaire, la rhynchosporiose, l’oïdium, et les charbons. Dans toutes les zones prospectées, la rayure réticulée de l’orge est la principale maladie qui cause de nombreuses pertes en rendement. L’agent fongique pathogène Pyrenophora teres Drechs., (anamorph: Drechslera teres [Sacc.] Shoem possède deux formes, P. teres f. teres (Ptt) et P. teres f. maculata (Ptm) qui se différencient au niveau des symptômes. L’étude des caractères morphologiques de P. teres a permis de distinguer quatre morphotypes, une variabilité de la pigmentation, du diamètre de la croissance mycélienne et de la mensuration des conidies. Cette variabilité n’est pas associée à la diversité géographique des isolats, en outre, elle ne permet pas de différencier les deux formes teres et maculata. L’étude du pouvoir pathogène de 60 isolats de P. teres a permis d’évaluer des degrés d’agressivité variable. Ces isolats inoculés à la variété sensible (Saida) provoquent des symptômes typiques de la rayure réticulée avec une réaction hétérogène. L’étude de l’interaction entre 48 isolats monospores de Ptt et 22 variétés différentielles d’orge a mis en évidence la présence de 12 pathotypes qui se diffèrent par leur virulence. Parmi les variétés différentielles, huit génotypes se sont révélés résistants vis-à-vis de tous les pathotypes identifiés dans notre étude, et de ce fait peuvent être retenues comme des géniteurs pour l’amélioration des variétés locales d’orge. L’évaluation du comportement de différentes variétés et lignées d’orge d’origine algérienne et syrienne vis-à-vis de cette maladie a révélé l’absence de la résistance complète chez les variétés testées. Les résultats de l’étude de l’activité antifongique des extraits aqueux de dix plantes médicinales vis-à-vis de Ptt ont montré que les extraits de Tetraclinis articulata, d’Anacyclus valentinus et d’Inula viscosa inhibent fortement la croissance mycélienne in vitro, et réduisent la sévérité de la maladie in vivo, ainsi que le taux d’inoculum porté par les semences d’orge. Ces résultats présentent un intérêt pour l’utilisation de ces extraits végétaux en protection phytosanitaire comme un procédé de lutte biologique basé sur l’utilisation des substances naturelles.
Production de métabolites: caractérisation et identification des arômes et des alcools
(Université Oran1 Ahmed Ben Bella, 2014-04-14) Rezki-Bekki Meriem Amina
L’objet de cette thèse avait pour but l’isolement des levures à partir de biotopes algériens et la caractérisation des souches qui possèdent des capacités intéressantes en termes de bio productions. La taxonomie moléculaire sur la base des séquences du domaine D1/D2 de l’ARN ribosomique 26S des isolats a aboutit à neuf espèces différentes. Notre étude s’est concentrée sur cinq espèces: Clavispora lusitaniae, Hanseniaspora uvarum, Kodamaea ohmeri, Issatchenkia orientalis et Trichosporon asahii qui proviennent de biotopes particuliers et sont très peu étudiées. L’étude des caractéristiques physiologiques ont permis de sélectionner la souche d’Issatchenkia orientalis (connu également sous le nom de Pichia kudriavezii) qui possèdent des potentialités importantes en production et résistance à l’éthanol qui en plus de sa résistance à de multiple stress comme les stress thermique, salin, osmotique et pH en fait une candidate idéale pour l’intensification de la production du bioéthanol. Cette étude a également porté sur le profil d’accumulation des alcools supérieurs chez ces souches cultivées sur milieu glucosé en absence et en présence d’excès en acides aminés: leucine, isoleucine et phénylalanine. Elles ont révélé une production importante de différentes molécules en particulier une production entre 250 et 300 mg/L du 2-méthylbutanol chez Clavispora lusitaniae, de 400 mg/L en 3-méthylbutanol pour la souche Kodamaea ohmeri. Quand à la souche I. orientalis, elle a montré une production remarquable en 2-phényléthanol avec une concentration très proche des 1000 mg/L représentant pratiquement le double de la concentration donnée par la souche contrôle S. cerevisiae CEN.PK122-2N. De plus, ce niveau de production très élevé du 2-phényléthanol par I. orientalis est corroboré par une grande résistance de cette levure à cet alcool supérieur allant à une concentration de 5 g/L. Cette dernière représente le double de la concentration à laquelle résiste la souche de référence S. cerevisiae.
Caractérisation moléculaire des bactéries impliquées dans la biodégradation des hydrocarbures
(2014-06-08) Guermouche M’rassi Amel
Les produits pétroliers, du fait de leur utilisation massive, constituent des polluants importants des aquifères et des sols. Le devenir de ces polluants rejetés dans l’environnement est principalement gouverné par les processus de biodégradation. L’existence de ces phénomènes dépend de la biodégradabilité intrinsèque du polluant mais aussi de la présence de microflores dégradatrices compétentes dans les eaux souterraines et dans les sols. Au cours de ce travail, nous avons développé une méthodologie permettant d’évaluer la biodégradabilité des hydrocarbures pétroliers en conditions aérobies. Elle consiste à mesurer, par méthodes analytiques telles: Chromatographie en Phase Gazeuse (CPG) et Chromatographie sur Couche Mince (CCM) couplées à un Détecteur à Flamme d’Ionisation (FID), après incubation dans des conditions optimales, la consommation de chacun des hydrocarbures présents dans différentes fractions du pétrole (saturés et aromatiques). En utilisant une méthode de séquençage des gènes codant l’ADNr 16S, les compositions en micro-organismes des bactéries adaptées au sol contaminé par les hydrocarbures ont été déterminées. Des arbres phylogénétiques ont été élaborés. Les capacités de dégradation des bactéries sélectionnées et la présence ou non de gènes fonctionnels de dégradation codant pour l’oxydation initiale des hydrocarbures (alkB, nahAc, nidA) ont été étudiées. Les résultats indiquent que le groupe Gamma-Protéobactéries était le principal acteur de cette dégradation. Pseudomonas sp. groupe bactérien majoritaire spécifique adapté à la pollution aux hydrocarbures à la capacité de métaboliser (en culture simple) certains hydrocarbures récalcitrants (alcanes ramifiés tel le Pristane (n-C19) à 35.11% et les aromatiques lourds tels le Benzo[a]Pyrène (n-C20) à 33.93% et de cométaboliser (en consortium) les différentes fractions du pétrole brut à 50.44% pour les saturés et à 30.42% pour les aromatiques polycycliques. L’efficacité de la biodégradation des microflores est liée à la présence de voies métaboliques particulières chez certains micro-organismes et à la coopération entre les différents micro-organismes composant les microflores. Ces bactéries hydrocarbonoclastes peuvent être utilisées pour concevoir des cultures mixtes (consortium) avec des capacités de biodégradation spécifiques pour les différentes fractions pétrolières dans les traitements des stations d’épuration.
Valorisation des symbiotes rhizosphériques et l’adaptation de la symbiose chez le haricot à la déficience de Phosphore dans l’agro-écosystème d’Ain Témouchent.
(2015-02-10) Benadis Chahinez
Les légumineuses ont une importance environnementale, alimentaire et socio-économique élevées, surtout pour les pays africains. Malgré leur intérêt, au cours de ces dernières années, leur culture est en baisse causée par des stress biotiques et abiotiques: variations de température, pauvreté en éléments minéraux des sols méditerranéens en particulier le phosphore. La capacité d'une association symbiotique avec des rhizobiums permet la fixation biologique de l'azote qui peut être exploitée pour améliorer la croissance des plantes et la fertilité des sols. L'inoculation par les rhizobiums joue un rôle important dans l'amélioration et l'augmentation du potentiel de fixation de l'azote en augmentant le nombre et le poids des nodules. Dans ce contexte, l'objectif de notre étude est de sélectionner un rhizobium efficient et génotypes de haricot tolérants pour améliorer la croissance et la production du haricot, de l'adapter à remédier aux contraintes, en particulier la carence en phosphore du sol. Deux variétés locales (Locale, Dj) et six lignées recombinantes contrastantes de haricot ont été semées en dualité in vitro et in campo en test multilocaux dans 20 parcelles à Ain Témouchent. 45 jours après semis, les paramètres de croissance et nodulation ont été évalués et les souches isolées des nodosités ont été affiliées par PCR-RFLP. La collection des 40 isolats a révélé une diversité intéressante. Pour 40 souches étudiées cinq ont été identifiés comme Rhizobium elti, 3 R. leguminosarum, 11 R. gallicum, 2 R. loti, et 6 Agrobacterium et 13 souches non identifiées. En test de nodulation, 29 souches ont réinfecté leurs génotypes hôtes. Les souches17 et 2 (R.etli) étaient les plus efficientes. Tous les génotypes ont été testés in vitro sous système hydroponique. Les plantes ont été soumises à deux niveaux de déficience en P et deux traitements d’inoculation avec Rhizobium etli CIAT 899 et R. etli CIAT 899-Glomus intraradices. Après 5 semaines de croissance, dans des conditions de serre, des mesures de consommation d'oxygène liées à la fixation de l'azote ont été réalisées sur la plante entière. La consommation d'O2 des nodules racinaires du haricot inoculé a été mesurée au stade floraison 45 jours après le semis (JAS). Les résultats montrent que la déficience en P diminue la consommation d’O2 des racines nodulées et affecte les paramètres de croissance en particulier la nodulation en diminuant le nombre, la taille et la biomasse sèche nodulaire. La nodulation est plus sensible à la carence en P que la croissance des plantes.
Réhabilitation de la culture du Lablab purpureus et études
(2015-02-15) Benselama Amel
Une collection de soixante souches isolées à partir des nodules de la légumineuse Lablab purpureus provenant de différentes régions d’Algérie, ont été caractérisées sur le plan phénotypique et génotypique. L’analyse de leur tolérance à la salinité, aux températures élevées, aux pH acides et alcalins, aux antibiotiques, ainsi que leurs caractéristiques symbiotiques et culturales ont permis de mettre en évidence une large diversité physiologique au sein de ces populations de rhizobia nodulant Lablab purpureus. L’analyse numérique de ces caractéristiques phénotypiques a montré qu’à un niveau de 86% de similarité. La SDS-PAGE est réalisée pour déterminer le profil des protéines totales des souches. Le phenodendogramme montre des coefficients de similitude des bandes polypeptidiques entre les isolats et les souches témoins confirmés l’appartenance de nos isolats aux groupes des rhizobia. L’amplification du gène ribosomique de l’ADNr 16S (PCR/RFLP de l’ADNr 16S) des isolats a révélé une grande diversité entre les souches et a confirmé la distinction de trois souches du genre Bradyrhizobium.
Caractérisation anthropogénétique d'un échantillon de la population algérienne : analyse des marqueurs parentaux
(2015-04-12) Bekada Asmahan
Grâce à leur position stratégique dans le bassin méditerranéen, les populations du Maghreb ont fait l'objet de plusieurs études qui témoignent de la complexité de leur structure génétique. La caractérisation génétique de ces populations a été effectuée par de nombreux marqueurs génétiques dont l'ADN mitochondrial (ADNmt) et le chromosome Y qui permettent de déterminer les origines géographiques des populations ancestrales et la composition révélée par le taux de métissage. Des influences eurasiatiques datant du Paléolithique et du Néolithique et de récentes contributions de l'Afrique subsaharienne et de l'Europe méditerranéenne ont été, ainsi, démontré. Cependant, ce scénario génétique est investi avec un écart notable, qui est le manque d'informations consistantes pour l'Algérie, le plus grand pays du Maghreb. La présente étude décrit la distribution de ces marqueurs uniparentaux et des microsatellites STR du chromosome X dans un échantillon de la population urbaine nord-ouest algérienne (n>200). L'analyse de 21 marqueurs X-STR a été réalisée par PCR multiplex. Les séquences de la région HVSI de l'ADNmt obtenues ont été comparées avec la séquence de référence rCRS (Revised Cambridge Sequence Reference) afin d'identifier les polymorphismes caractérisant les haplogroupes. Pour approfondir cette détermination nous avons analysé les polymorphismes RFLP et SNP, par PCR-RFLP et par miniséquençage SNapShot, respectivement. Concernant l'analyse du chromosome Y, nous avons affiné les résultats, d'une étude précédente dans notre population, par séquençage et détection de 12 polymorphismes SNP déterminant des sous-groupes des haplogroupes E et R, très répandus en Afrique du Nord et en Europe, respectivement. L'analyse statistique des résultats a été réalisée par les logiciels Arlequin (pour le calcul de l'indice de fixation FST, la diversité génétique (h) et pour l'analyse de la variance moléculaire AMOVA), Network et Phylip (pour la réalisation des arbres phylogénétiques), SPSS (pour la réalisation des analyses en composant principal ACP). L'évaluation de la distance génétique sur la base des haplotypes X-STR indique que les Algériens sont proches génétiquement des populations eurasiatiques mais restent assez éloignés des populations de l'Afrique subsaharienne. L'analyse de l'ADN mitochondrial a permis de définir plus de 40 haplogroupes majeurs dont la plus forte fréquence a été observé pour les haplogroupes d'origine eurasiatique : H/HV M1, U6a (30.83%, 7.08%, 6.67%, respectivement. En effet, le composant eurasiatique en Algérie a atteint plus de 80 % pour les deux marqueurs uniparentaux et se traduit par des fréquences élevées (70 %) des haplogroupes du chromosome Y : E-M81 et E-V65. La présence inattendue des dérivées de l'haplogroupe R européen du chromosome Y: R-M412, R-S116, R-U152 et R-M529 en Algérie et le reste du Maghreb semblent constituer les contreparties des sous-groupes de l'ADNmt H1, H3 et HV0. Ceci traduirait les contacts maritimes entre les cÃ´tes européennes et nord-africaines de l'ouest de la Méditerranée. Malgré les asymétries sexuelles observées, les profils génétiques uniparentaux des Algériens corrèlent fidèlement entre eux et correspondent parfaitement aux gradients de fréquence des haplogroupes est-ouest et nord-sud observés au nord de l'Afrique. Les résultats de l'analyse du chromosome X sont en accord avec ceux des marqueurs uniparentaux qui estime la contribution féminine et masculine subsaharienne à 20 et 10%, respectivement. Finalement, cette étude devrait être étendue à d'autres échantillons de population, notamment des ethnies berbères, nombreuses sur le grand territoire national Algérien, et d'avoir plus de données sur plus de marqueurs de différents loci. C'est bien l'étude de différents marqueurs génétiques croisés à des éléments archéologiques, linguistiques, ethnologiques et démographiques qui permettront d'obtenir une meilleure compréhension de l'histoire des populations d'Algérie et de leurs relations avec d'autres populations nord africaines, eurasiatiques et subsahariennes.
Evaluation des systèmes de management de la sécurité et de la qualité de l’aquaculture du tilapia du Nil
(2015-04-23) Dergal Nadir Boudjlal
Cette thèse a été entreprise afin d’élaborer et de développer le premier modèle HACCP spécifique pour la gestion de la qualité ante et post mortem du tilapia (Oreochromis niloticus) produit au niveau de la ferme continentale "Fat-Steppes" (Ouest algérien). Pour ce faire, différents points critiques (PCC) ont été déterminés et maitrisés tout au long de la phase d’élevage et de commercialisation. Durant la phase d’élevage, les résidus d’antibiotiques, les résidus de la 17 α -méthyle testostérone et la qualité microbiologique et physicochimique de l’eau et de l’aliment d’élevage ont été évalués. Une stratégie analytique pertinente a été développée basée sur une première technique microbiologique de screening qui a été améliorée et partiellement validée pour l’identification des tétracyclines et des fluoroquinolones. Suivie d’une seconde technique LC-UV-MS qui a été spécialement optimisée pour l’identification et la quantification de l’acide oxolinique. Une nouvelle méthode d’extraction, compatible avec un test immuno-enzymatique ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay), a été optimisée pour la détection des résidus de 17α-méthyle testostérone (MT) dans la chair du poisson, dans l’eau et l’aliment d’élevage. Le profil nutritionnel du tilapia produit à Fat Steppes a été caractérisé en déterminant sa composition en macronutriments, son profil en acides gras et en acide aminés. Par la suite, l’évolution temporelle de la qualité hygiénique, du tilapia conservé à 4°C et 30°C, a été évaluée par une approche sensorielle, microbiologique (Flore Mésophile Aérobie Totale et Entérobactéries) et biochimique. L’analyse des diènes conjuguées, des hydroperoxydes et des TBARS "Thiobarbituric acid reactive substances" a servi pour évaluer l’oxydation lipidique. L’analyse d’azote basique volatil totat "ABVT", la triméthylamine "TMA" et les amines biogènes a servi pour évaluer la protéolyse bactérienne et enzymatique. Les résultats obtenus ont démontrés des performances satisfaisantes des deux techniques d’analyse des résidus d’antibiotiques. La capacité de détection (CCß) du test de screening est de 0,75 fois la limite maximale de résidus (LMR) de l’acide oxolinique (OXO) et la limite de la quantification chromatographique LC/UV est de LMR/20. Le délai d’attente de l’OXO est estimé à 08 jours après un traitement de six jours successifs avec une dose de 12 mg/ kg de poids vif. La nouvelle méthode d’extraction des résidus d’MT est acceptable en termes de rendement d’extraction (55 % pour la chair et 85 % pour l'eau) et de linéarité (R2 = 0,998). Le délai d’attente des résidus de la MT est estimé à deux mois après un traitement avec une dose 65 mg MT/kg d’aliment, pendant 28 jours, à partir du 10ème jour post-éclosion. Des seuils microbiologiques de 103 ufc/100 ml de coliformes fécaux et de 3 x 106 ufc/g de flore mésophile aérobie totale (FMAT) sont retenus comme critères de bonne qualité microbiologique de l’eau et de l’aliment d’élevage respectivement. Le tilapia algérien est considéré comme un poisson maigre (± 0,33 % de lipide) et riche en protéines (± 17,3 %). Son profil en acides aminés essentiels et en acides gras polyinsaturés est relativement intéressant. Les paramètres de performance de la nouvelle méthode HPTLC "High Performance Thin Layer Chromatography", développée pour le screening et la quantification de six amines biogènes d’intérêt, sont satisfaisants en termes de linéarité (R2 > 0,98), de justesse (> 84 %), de fidélité. La limite de détection (LOD) de la méthode HPTLC est de l’ordre de 5 µg.g-1 de chair de poisson. Les résultats de l’analyse organoleptique, microbiologique et biochimique sont fortement et positivement corrélés et révèlent que la date d’utilisation optimale du tilapia est limitée à 12 heures et à 05 jours de conservation à 30°C et à 4°C respectivement. Après ces délais, le poisson est rejeté par l’appréciation organoleptique et tous les seuils critiques établis dans ce travail sont dépassés. Des valeurs de l’ordre de : 6 log cfu g-1 pour les FMAT et les entérobactéries, 0,85 mg MDA kg-1 de poids humide, 35 mg ABVT-N 100 g-1 de chair, 8 mg TMA-N 100 g-1 de chair, 100 µg.g-1 de putrescine et de cadavérine sont retenus comme critères microbiologiques et biochimiques respectivement.
Bioremediation et Rehabilitation des Sols a Ouled Boudjemaa
(2015-06-25) El-Hachemi Mohammed Fayçal
Plusieurs fonctions sont essentielles à la croissance d’une végétation pour la réhabilitation des sols dégradés (Calcium, Magnésium, Potassium, Azote…etc.), dont le besoin d’un apport suffisant en matière organique et en capacité d’échange cationique. Face a l'augmentation des déchets agro-industriels qui posent un réel problème dans la détérioration du milieu naturel, nous avons mené une étude expérimentale (In vitro et In vivo) pour la mise au point d’un compost de fertilisation issu du recyclage des résidus de l’industrie des huiles de tables, dans le but de réhabiliter les sols dégradés de la carrière de Ouled Boudjema (Wilaya de Ain Temouchent). Nos résultats préliminaires résument quelques rôles essentiels que jouent ces résidus d’Argile de neutralisation et de raffinage (Terre décolorante) dans les essais de développement des nouvelles plantations d’Acacia saligna.
Évaluation et Modélisation de la Dynamique des Populations Microbiennes en Relation avec les Caractères Edaphiques des Sols de Carrière de Terga (Ain Témouchent) en Vue de leur Revégétalisation
(Université oran1 Ahmed Ben Bella, 2016-03-16) Delal Hassiba
Dans le cadre global de la préservation de la biodiversité et des ressources naturelles (nappes phréatiques, sols et milieux aquatiques) et l’impératif de limitation des émissions dans le milieu naturel des fertilisants et autres intrants chimiques, nous nous sommes engagés par des essais et travaux expérimentaux sur le terrain à rechercher d’autres méthodes et moyens alternatifs de fertilisation biologique axés sur l’intérêt écologique et les apports des microorganismes associés dans la réhabilitation progressive des sols et paysages dégradés. Notre étude a été effectuée dans la carrière-sablière de Terga qui est située à l’embouchure de l’Oued EL Malah (latitude de 35° 25′ 07″ Nord et longitude de 1° 10′ 39″ Ouest) située dans la wilaya d’Ain Témouchent (littoral du nord-ouest algérien). Cette région présente un problème majeur de dégradation des sols qui conduit souvent à l’abandon des grandes superficies cultivables et à une forme de désertification progressive du milieu naturel. Pour réhabiliter les sols et paysages dégradés de cette zone, notre recherche s’est proposée d’identifier et d’étudier l’activité des populations microbiennes en confrontant les résultats à la caractérisation du milieu qui ont révélé que le sol est très pauvre en éléments nutritifs et matière organique ( inférieure à 1%) en présence d’un pH alcalin (pH~9). Ces conditions défavorables entravent le développement de la flore microbienne du sol indispensable pour la croissance et nutrition des plantes, d’où l’intérêt de révéler et étudier la population microbienne naturelle des sols de Terga selon trois sites d’échantillonnage différents (Sol nu ; Sol de la forêt native et sol revégétalisé par l’homme) durant les quatre saisons de l’année. Les analyses microbiologiques des sols ont décelé des différences entre les trois sites étudiés. Tous les résultats obtenus pour ces sites montrent qu’ils sont plus riches en micro-organismes. L’influence de la saison a montré aussi un très grand développement de la population microbienne où la densité végétale pourrait avoir une influence sur la répartition et richesse des sols en microorganismes. Une évaluation numérique et qualitative a été dressée afin de préparer une étude de modélisation mathématique qui permet de simuler la dynamique des populations microbiennes dans ces sols de carrières et comprendre ainsi les processus biotiques naturels de réhabilitation et revégétalisation tels que les sols dégradés.
BNL associées aux légumineuses alimentaires (Vicia faba L) dans l’ouest Algérien « caractérisation et importance »
(Université oran1 Ahmed Ben Bella, 2016-04-28) Ouslim Sarah
Les légumineuses alimentaires sont considérées depuis longtemps comme les plantes à graines les plus cultivées par l’homme. Elles jouent un rôle important dans le développement de l’économie nationale des pays du Maghreb. La fève (Vicia faba L) est parmi les légumineuses alimentaires les plus cultivées pour l’alimentation humaine et joue aussi un rôle important dans la fertilisation des sols. Dans le but d’améliorer la production de cette culture stratégique pour la sécurité alimentaire dans le pays, nous avons entrepris une étude de caractérisation phénotypique des rhizobia associées à la fève dans l’ouest algérien afin de sélectionner par la suite en serre et au champ les souches potentiellement intéressantes à proposer comme inoculum biologique. Pour réaliser ce travail, plusieurs missions de prospection ont été menées dans l’ouest algérien au cours desquelles nous avons récolté des plantes et des nodules de (Vicia faba L). Les nodules ainsi récoltés nous ont servi à l’isolement direct de souches de rhizobia. Une collection de 140 isolats a été obtenue et caractérisée par des tests phénotypiques. Quarante isolats présentent une morphologie comparable à celle des rhizobia connus, les colonies obtenues présentent une forte mucosité et n’absorbent pas du rouge Congo. Le test de nodulation in-vitro en conditions contrôlées a confirmé l’infectivité et l’efficience de trente souches vis-à-vis de leurs plantes hôtes et c’est celles-ci qui ont été retenues pour des tests physiologiques et biochimiques. La majorité des souches se distinguent par leur particulière tolérance à la salinité (600mM NaCl), à des pHs allant de 5 à 11 et à des températures extrêmes comprises de 15 à 40°C. et résistent à de nombreux antibiotiques dont l’Ampicilline. Pour les tests d’inoculation au champ, nous avons choisi trois souches de rhizobia sélectionnées sur la base de leur efficience (mesure du poids sec des parties aériennes et racinaires) en serre sous conditions contrôlées et de leur particularité physiologique. Les essais ont été menés au champ durant la saison pluvieuse dans le centre de formation de Misserghine à l’Ouest algérien. Cinq traitements ont été appliqués : une inoculation avec trois souches de Rhizobium sp. représentant la souche la plus effective (la souche FM.24), moyennement effective (la souche FR36) et la moins effective (la souche FR26.4.2), un témoin azoté et un sans azote sont inclus. Les résultats obtenus montrent que la fertilisation azotée entraine une augmentation de la biomasse aérienne et une diminution de la biomasse nodulaire contrairement à l’inoculation avec les souches de Rhizobium sp. qui entraine une augmentation de la biomasse racinaire et aérienne, et une augmentation significative du rendement en gousses et en graines ce qui encourage l’utilisation des souches de Rhizobiums comme inoculum biologique. Dans cet essai, la souche FM20.4 originaire de la région de Mostaganem est la plus efficiente par rapport aux autres souches sélectionnées et qui se sont avérées nettement moins compétitives et moins effectives que les souches indigènes. Mots clé ; Vicia faba - rhizobia--symbiose – Diversité –Phénotypique - Inoculation.
Etude du déterminisme génétique de la thermotolérance chez des lactocoques atypique issus du lait cru de chamelle d’Algérie
(Université Oran1 Ahmed Ben Bella, 2016-05-05) Gabed Noujoud
La résistance bactérienne vis-á vis le stress physique telle que la thermotolérance, est un phénotype complexe et partiellement connu. Nous réalisons une analyse détaillée et comparative de la séquence génomique de la souche modérément thermotolerante Lactococcus lactis. ssp. lactis GL2 afin de déterminer les gènes ainsi que les protéines impliqués dans sa résistance aux températures élevées. Trois souches de références complètement séquencées L. lactis ssp. lactis et deux souches appartenant á la ssp. cremoris sont incluses dans l´analyse comparative. Les gènes/protéines étudiés comprennent i) les protéines du choc thermique classe I (DnaK, DnaJ, GroESL, GrpE) et leur répresseur transcriptionnel HrcA, ii) les protéines du choc thermique classe III (ClpB, ClpC, ClpE, ClpP, ClpX) et leur régulateur négatif CtsR. L´analyse détaillée de la région 5´ du hrcA de ssp. lactis a révélé une ambigüité non signalée jusqu´á présent dans l´identification du premier codon dans sa traduction ainsi que la présence d´une séquence signal potentielle non traduite avec des caractéristiques intéressantes. Cette séquence est absente chez ssp. cremoris. Autres gènes/protéines visés incluent iii) RecA, pour laquelle, nous avons identifié exceptionnellement deux gènes différents, iv) FtsH et LexA-like régulateur HdrI, qui interagissent avec RecA, et v) HtrA, GdpP et le system á deux composante CesSR.
Symbioses telluriques : Rôle et mécanisme de tolérance aux stress abiotiques
(Université oran1 Ahmed Ben Bella, 2016-05-23) Nehila Afaf
Une étude du statut mycorhizien est entreprise dans deux sites salins et deux sites dunaires à partir du sol rhizisphérique des plantes d’intérêts afin d’isoler et de sélectionner des CMA performants pour leur utilisation ultérieure dans l’inoculation d’A. saligna et de L. creticus. Cette étude a décelé une différence entre les sites salins et les sites dunaires. Ces derniers abritent un nombre réduit de propagules MA mais les racines de leurs plantes sont fortement mycorhizées, contrairement aux sols salins, suggérant que la salinité affecte négativement la germination des spores et la colonisation racinaire des plantes hôtes, provoquant l’accumulation des spores dans le sol. Sur la base des caractéristiques morphologiques des spores, une diversité de glomale (45 morphotypes) est mise en évidence. Elle est plus importante dans les sols dunaires que dans les sols salins suggérant ainsi que les conditions édaphiques et pédologiques affectent le comportement, la diversité et la distribution des CMA. La performance des isolats, issus de culture monosporale, est testée vis-à-vis du stress salin et hydrique, permettant de sélectionner cinq isolats des différents sites: AT6, LT3, LB2, SST5 et 3S6. La croissance et les paramètres biochimiques, sous stress salin (150 mM et 300 mM de NaCl), sont évalués chez A. saligna et L. creticus inoculées avec les isolats sélectionnés, un mixte des CMA isolés et une combinaison de ce dernier avec une souche de rhizobium. Les résultats montrent que la salinité a affecté négativement le développement d’A. saligna et de L. creticus mais l’inoculation a permis de freiner l’effet dépressif du sel. La meilleure tolérance est observée chez les plants inoculés avec la combinaison rhizobium et mixte de CMA, par contre, la simple inoculation avec les isolats MA n’a aucun effet dans la tolérance d’A. saligna et de L. creticus. Les résultats montrent également que pour A. saligna, l’efficacité des CMA ne semble pas liée à leur adaptation au sel ni à la plante hôte alors qu’elle est liée à la plante hôte dans le cas de L. creticus.
ETUDE DE LA DIVERSITÉ DES TRUFFES DU DÉSERT ET DE LEURS ASSOCIATIONS MYCORHIZIENNES
(Université oran1 Ahmed Ben Bella, 2016-06-02) Zitouni Fatima El-Houaria
Ce travail a pour objectifs principaux la caractérisation phénotypique et génotypique des truffes du désert d’Algérie ainsi que l’étude de leurs associations mycorhiziennes. Les analyses morphologiques et phylogénétiques basées sur le séquençage des espaces intergéniques ITS de l’ADNr effectuées sur une collection de 73 spécimens de truffes du désert récoltés de 26 stations productrices de terfez ont permis d’identifier sept espèces de truffes du désert d’Algérie appartenant aux genres Terfezia (T. arenaria, T. boudieri, T. claveryi), Tirmania (T. pinoyi,T. nivea) et Picoa dont l’identité taxonomique des espèces n’est pas pleinement claire. Les analyses phylogénétiques des séquences ITS de l’ADNr de plusieurs taxa de Picoa provenant d’Algérie et de différents pays situés sur le pourtour du bassin méditerranéen ont révélé un degré élevé de variabilité génétique dans l’ensemble du genre et une forte affinité taxonomique entre les deux espèces de Picoa. La structure génétique du genre Picoa semble être influencée par les caractéristiques écologiques de leur biotope, en particulier la nature bioclimatique de leurs habitats ainsi que leurs phytosymbiotes du genre Helianthemum. Les analyses des liens phylogénétiques effectuées sur les séquences ITS de plusieurs taxa de Terfezia et Tirmania ont révélé une remarquable variabilité génétique inter- et intraspécifique notée particulièrement chez Terfezia claveryi y compris pour certains spécimens récoltés de la même station. La répartition génétique des espèces de Terfezia et Tirmania peut refléter probablement une spécificité vis-à-vis de la plante hôte ou plus précisément son type morphologique ou biologique. L’étude des associations mycorhiziennes entre six espèces de truffes du désert et dix espèces végétales révèle la formation de deux types de mycorhizes dont la morphologie diffère selon le type biologique de la plante hôte. En effet, les thérophytes et les chaméphytes forment avec deux espèces de Terfezia des endomycorhizes terfezioïdes typiques tandis que les phanérophytes forment avec les Terfezia et Tirmania des ectomycorhizes avec un manteau fin peu développé et un réseau de Hartig bien différencié. D’autres travaux ont été effectués parallèlement aux précédentes études : La germination des ascospores de Picoa lefebvrei est obtenue pour la première fois sur le milieu Oddoux, après une phase de latence de 120 jours. Une étude des aspects écologiques des truffes du désert dans un habitat steppique a révélé que le développement et la production de ces champignons sont étroitement liés aux facteurs pédoclimatiques (caractéristiques physico-chimiques du sol, intensité et répartition annuelle des précipitations, fréquence des orages, etc.) ainsi que la présence des plantes hôtes naturelles des terfez Helianthemum hirtum et H. salicifolium (Cistaceae). Les ascomes des Picoa sp. se sont avérés très vulnérables aux attaques d’un ascomycète mycoparasite proche de « Melanospora zobelii » et d’un insecte mycophage.Une enquête ethnomycologique menée dans une station à terfez auprès de 40 personnes nous a fourni de précieuses informations sur: la période des précipitations influençant le développement des terfez, la récolte des ascomes et les indices de repérage des gîtes, les outils utilisés pendant la récolte des ascocarpes et les précautions à prendre, une estimation de la quantité de truffes du désert récoltées chaque année, les méthodes de conservation des ascomes après leur récolte, leur vente sur les marchés locaux ou internationaux, les préparations culinaires et enfin leur utilisation en médecine traditionnelle.

Parcourir par

Parcourir la collection Thèses de Doctorat "Biotechnologie" par Date de publication

Résultats par page

Options de tri