Etude du déterminisme génétique de la thermotolérance chez des lactocoques atypique issus du lait cru de chamelle d’Algérie
Etude du déterminisme génétique de la thermotolérance chez des lactocoques atypique issus du lait cru de chamelle d’Algérie
Fichiers
Date
2016-05-05
Auteurs
Gabed Noujoud
Nom de la revue
ISSN de la revue
Titre du volume
Éditeur
Université Oran1 Ahmed Ben Bella
Résumé
La résistance bactérienne vis-á vis le stress physique telle que la thermotolérance, est un phénotype complexe et partiellement connu. Nous réalisons une analyse détaillée et comparative de la séquence génomique de la souche modérément thermotolerante Lactococcus lactis. ssp. lactis GL2 afin de déterminer les gènes ainsi que les protéines impliqués dans sa résistance aux températures élevées. Trois souches de références complètement séquencées L. lactis ssp. lactis et deux souches appartenant á la ssp. cremoris sont incluses dans l´analyse comparative. Les gènes/protéines étudiés comprennent i) les protéines du choc thermique classe I (DnaK, DnaJ, GroESL, GrpE) et leur répresseur transcriptionnel HrcA, ii) les protéines du choc thermique classe III (ClpB, ClpC, ClpE, ClpP, ClpX) et leur régulateur négatif CtsR. L´analyse détaillée de la région 5´ du hrcA de ssp. lactis a révélé une ambigüité non signalée jusqu´á présent dans l´identification du premier codon dans sa traduction ainsi que la présence d´une séquence signal potentielle non traduite avec des caractéristiques intéressantes. Cette séquence est absente chez ssp. cremoris. Autres gènes/protéines visés incluent iii) RecA, pour laquelle, nous avons identifié exceptionnellement deux gènes différents, iv) FtsH et LexA-like régulateur HdrI, qui interagissent avec RecA, et v) HtrA, GdpP et le system á deux composante CesSR.
Description
Mots-clés
Lactococcus lactis,
thermotolerance,
protéines du choc thermique,
facteur de transcription,
HrcA,
RecA,
séquençage,
Technologie NGS,
Déterminisme génétique,
CtsR