Thèses de Doctorat "Biologiques"
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- ItemEthique et cancer(Université Orran1, 2025-12-03)Le cancer est un enjeu majeur de santé publique dont la prise en charge pose des défis diagnostiques, thérapeutiques et éthiques importantes. Cette thèse analyse ces enjeux à travers une étude théorique et une enquête épidémiologique rétrospective menée dans l’Ouest algérien, au CHU d’Oran, Service d’Oncologie Médicale. La partie théorique examine les principes de l’éthique biomédicale (autonomie, bienfaisance, non-malfaisance, justice) et leur application en oncologie, notamment dans l’annonce du diagnostic, le consentement éclairé, la proportionnalité thérapeutique et l’équité d’accès aux soins. La partie pratique analyse 525 dossiers (2016–2024). Les résultats montrent une prédominance masculine (66,09 %), une majorité de patients âgés de 30–60 ans (73,52 %), et une fréquence élevée de mortalité des cancers du poumon (32 %), du sein (19,23 %) et du côlon (17,14 %), dont 89,9 % d’adénocarcinomes. Les principaux facteurs de risque identifiés sont le tabagisme (58,28 %), l’alcool (20,95 %), le cannabis (12 %), ainsi que les expositions professionnelles (14,28 %). L’étude met en évidence un diagnostic tardif, une forte dépendance au secteur privé pour les examens (85,71 %), un faible soutien psychologique (19,61 %) et un manque d’équipements tels que la radiothérapie. Dans le cancer du sein (101 cas), le délai moyen de consultation atteint 10,3 mois, favorisant des diagnostics à un stade avancé. Ces constats soulignent la nécessité de renforcer l’intégration des principes éthiques afin d’améliorer la qualité, l’équité et l’efficacité de la prise en charge oncologique dans l’Ouest algérien.
- ItemEtude des bactéries lactiques bactériocinogènes et leurs exploitation industrielle(Université Oran1, 2025-12-11)À partir de 15 échantillons de produits laitiers algériens crus, comprenant le lait de chamelle, le lait de chèvre, le Leben et le Jben, un total de 250 souches de bactéries lactiques (LAB) ont été isolées. Une sélection rigoureuse, fondée sur le potentiel antimicrobien des isolats, a permis d’identifier 12 souches présentant des propriétés technologiques et probiotiques prometteuses, offrant des perspectives intéressantes pour des applications dans l’industrie agroalimentaire. L’identification phénotypique et génotypique a révélé que ces souches appartenaient aux espèces Lactiplantibacillus plantarum (cinq souches) et Weissella cibaria (sept souches), avec une homologie supérieure à 99 %. La caractérisation technologique de ces souches a révélé leur aptitude à acidifier efficacement le lait, à exhiber une activité protéolytique significative, à utiliser le citrate comme substrat fermentescible, ainsi qu’à synthétiser des métabolites d’intérêt tels que l’acétoïne, les exopolysaccharides, une diversité d’acides organiques et la riboflavine. Les taux de production d'exopolysaccharides (EPS) et de riboflavine ont présenté une variabilité selon les souches. En effet, la quantification des EPS a révélé des valeurs comprises entre 1,08 ± 0,24 mg/mL et 4,7 ± 0,02 mg/mL, tandis que la production de riboflavine a varié entre 0,40 mg/L et 2,40 mg/L. L’identification des acides organiques produits par les LAB a démontré que l’acide acétique était le plus abondant chez toutes les souches de LAB testées, avec une production dépassant les 30 g/L, suivi de l’acide lactique, dont la concentration était supérieure à 5 g/L. L’évaluation du profil probiotique des souches de LAB, notamment leur capacité à inhiber la croissance de microorganismes potentiellement pathogènes tels que Listeria innocua et Pseudomonas aeruginosa, a révélé que deux souches, l'une appartenant à W. cibaria VR81 et l'autre à L. plantarum R12, possédaient un potentiel de production de substances antimicrobiennes de nature protéique, résistantes aux températures élevées et aux pH acides. Ces mêmes souches ont également démontré une bonne résistance aux conditions gastro-intestinales, avec une viabilité supérieure à 60 % à pH 2 et pH 3, ainsi qu'une augmentation de la croissance à pH 4. De plus, elles ont montré une résistance notable aux sels biliaires et à la pepsine, avec une viabilité supérieure à 80 %. Ces souches ont également présenté de bons résultats d'auto-agrégation et de co-agrégation, ainsi que des capacités d'adhésion supérieures aux cellules Caco-2, ce qui renforce leur potentiel en tant que probiotiques efficaces. L'application in vivo de W. cibaria et L. plantarum en tant que cultures starters primaires, tant en monoculture qu'en coculture, pour la fermentation du quinoa a entraîné une acidification efficace de la matrice (∆pH de 2,03 unités) et la production d'une boisson de haute qualité. Le challenge test réalisés contre L. innocua a montré une inhibition totale de ce pathogène lorsque L. plantarum était inclus dans le starter, que ce soit seul ou en combinaison avec W. cibaria. Les deux espèces ont également présenté des capacités d'inhibition contre Staphylococcus et des champignons filamenteux. De plus, la coculture des souches mutantes de L. plantarum R12d et W. cibaria VR81d a permis d'atteindre des niveaux de riboflavine de 175,41 µg/100 g dans le quinoa fermenté, soulignant ainsi leur potentiel en tant que cultures starters pour la fermentation, la biopréservation et la biofortification du quinoa, tout en conservant des caractéristiques probiotiques prometteuses. L’utilisation de W. cibaria et L. plantarum pour la bioconservation de la courge fraîchement coupée, conditionnée à 4°C, a également montré son efficacité. En effet, l'application de 1 % de surnageant filtré des deux souches, combinée avec la courge, a permis de maintenir non seulement une meilleure apparence visuelle, mais aussi une qualité microbiologique supérieure. La combinaison des surnageants filtrés (CFS) des deux souches de LAB a entraîné une inhibition totale de L. innocua à partir du 17e jour de stockage, ce que la conservation par CO2 n’a pas permis d’obtenir. En outre, l'intégration combinée des surnageants des LAB a permis de réduire également de manière significative la croissance de la flore aérobie mésophile totale, ainsi que celle des levures et moisissures, en comparaison avec le traitement par CO2 seul. Ainsi, cette étude met en évidence le potentiel des souches de W. cibaria et L. plantarum en tant que candidats prometteurs pour la bioconservation, le biocontrol et la biofortification des produits alimentaires, ouvrant ainsi la voie à leur application dans des systèmes alimentaires durables.
- ItemEffets comparés des hydrolysats de protéines végétales (cicer arietinum) ou marines (sardina pilchardus) sur le métabolisme des lipides et des lipoprotéines et leurs susceptibilité à l ‘oxydation chez le rat Wistar consommant un régime enrichi en cholestérol(Université Oran1, 2025-06-30)Le but de cette étude est de comparer chez le rat la capacité des hydrolysats de protéines de la sardine avec ceux de pois chiche à prévenir la dyslipidémie ainsi que le stress oxydatif et l’état inflammatoire induit par un régime enrichi en cholestérol. Des rats mâles de souche Wistar (n=24) pesant 210 ±10 g sont divisés en 3 groupes et soumis à un régime de 20% de caséine, 1% de cholestérol et 0,5% d’acide cholique pendant 28 jours. 2 Groupes reçoivent quotidiennement par gavage une solution d’hydrolysats de protéines de pois chiche (HPC) ou de sardine (HPS) (250 mg.kg-1 de poids corporel de rat). Le troisième groupe reçoit de l’eau et constitue le groupe témoin (T). Les résultats ont montré que le CPH a réduit le poids corporel (p < 0,05) par rapport aux groupes HPS et T ainsi que le poids relatif du foie. Cependant, l'excrétion fécale du cholestérol était 1,8 fois plus élevée dans le groupe HPC vs HPS et T. En revanche, l’hydrolysat des protéines de pois chiche et particulièrement HPS réduisent la cholestérolémie et la triglycéridémie respectivement de -1,5-, -1,2-fois chez le groupe HPC et de -2,9-, -1,5-fois chez le groupe HPS. Ces mêmes hydrolysats et particulièrement ceux de HPC diminuent les teneurs en CT et en EC au niveau hépatique comparées avec ceux de T. Cette diminution s'accompagne d'un contenu fécal élevé, avec une excrétion 1,8-fois plus importante dans le groupe HPC comparé aux groupes HPS et T, alors que celle du groupe HPS reste similaire au groupe T. Par ailleurs, HPC a stimulé significativement l’activité LCAT l’enzyme responsable du transport inverse du cholestérol. L’évaluation du statut redox montre que les teneurs en hydroperoxydes et en MDA sériques et érythrocytaires sont significativement plus faibles chez HPS et HPC. Cette diminution est concomitante avec la réduction des concentrations en MDA et en hydroperoxydes VLDL chez les 2 groupes traités. En revanche les HPC réduisent significativement les taux de MDA et hydroperoxydes des LDL. Comparés au groupe T, les concentrations en isoprostanes sériques sont respectivement 1,3-, 3-fois plus faibles chez HPC et HPS et cette valeur est 2,3-fois plus faible chez HPC vs HPS. Chez le groupe traité avec HPC, les teneurs en dérivés carbonylés sont respectivement 1,3- et 2,8-fois plus faibles au niveau du sérum et de l’aorte par rapport au groupe T. De même, la capacité antioxydante des HDL est nettement plus importante chez ce même groupe vs HPS et T. Cette capacité antioxydante des HDL obtenue avec HPC résulte d’une augmentation de l’activité LCAT (+38%) et PON1 (+8%). Par ailleurs, les concentrations en hydroperoxydes des rats traités avec HPC et HPS sont plus élevées au niveau de l’aorte alors qu’au niveau des érythrocytes ces valeurs sont plus faibles de -10% comparées aux rats hypercholestérolémiques non traités. Les concentrations en MDA des érythrocytes sont significativement plus faibles chez les deux groupes traités vs T. Par contre, ce contenu n’a été réduit qu’au niveau de l’aorte par HPS. De plus, les plus faibles teneurs en monoxyde d’azote sont notées chez le groupe HPS. Ces valeurs sont significativement diminuées de -55% au niveau des érythrocytes et de l’aorte par rapport aux groupes HPC et T. Toutefois, les HPS ont induit une plus forte activité superoxyde dismutase (SOD) sérique comparés aux HPC alors que celle de la glutathion peroxydase (GPx) est restée similaire chez tous les groupes. En revanche, les HPC ont augmenté l’activité SOD et catalase des érythrocytes de +46% et +90% par rapport à celles des rats traités avec HPS et de +79% et +82% par rapport aux rats témoins. L’exploration du statut inflammatoire révèle que les HPS et en particulier les HPC diminuent les teneurs plasmatiques en fibrinogène et les teneurs sériques en acide urique, albumine et CRP qui sont de 9%, 11 % et de 22% respectivement. En conclusion, en plus d’une activité anti-inflammatoire avérée, les hydrolysats de protéines de sardine et particulièrement ceux du pois chiche exhibent des propriétés antioxydantes et hypocholestérolémiantes, ce qui suggère fortement le potentiel thérapeutique en tant qu'agents nutraceutiques pour prévention des maladies cardiovasculaires à la fois et l’amélioration du profile lipoprotéique (via la réduction des fractions athérogènes VLDL/LDL) ainsi que la modulation du stress oxydatif et inflammatoire.
- ItemMutations of the EGFR Gene in Patients with Non-smallCell Lung Cancer Belonging to a Population in Western Algeria.(Université Oran1, 2025-11-22)Worldwide, lung cancer ranks first in terms of incidence and mortality. In Algeria, this cancer represents the third most commonform of cancer afte rbreast and colorectal cancers and the second cause of death after breast cancer. In this workour objective was to comprehensive lycharacterize the epidemiological and molecular profile of lung cancer in western Algeria. The molecular analysis involved a case-control study investigatingtwo EGFR polymorphisms (rs2072454 and rs2227983) (via PCR-RFLP) and an observational retrospective study analysing EGFR mutations (via real-time PCR) in NSCLC patients. First, wecarried out an in-depth epidemiological analysis of 312 medical records which revealed a predominance of men and smokers (87% and 83% respectively). Notably, female patients were overwhelmingly non-smokers (98%) and predominantly developed ADC (88%). Significant associations were identified for tobacco and cannabis use (p<0.05), but not alcohol consumption. Occupational exposures in construction and industrial sectorswas the most frequent constituting potential risk factors among male patients. Comorbidities were presentin 56% of patients, with hypertension (23%) and diabetes (13%) being most prevalent. A family history of cancer was reported in 25% of cases, showing a significant correlation with age at diagnosis (p<0.005), suggesting potential hereditary predisposition patterns. Second, our case-control study involving 143 participants (73 lung cancer cases and 70 healthycontrols) demonstrated that the EGFR rs2072454-CT genotype conferred a 2.35-fold increasedrisk of lung cancer (95% CI 1.04-5.30, p=0.04), while the rs2227983-AG variant wasspecifically associated with a 2.76-fold elevated ADC risk (95% CI 1.0-7.5, p=0.04). Third, weperformed a molecular profiling of 71 NSCLC FFPE tissue specimens that identified EGFR mutations in 28% of cases (72% wild-type), with 60% exhibiting single mutations (predominantly L858R [n=7], followed by S768I [n=3] and L861Q [n=2]) and 40% displaying compound mutation patterns, including four distinct double-mutation combinations (T790M+L861Q [n=1], DEL+L858R [n=2], L861Q+G719X [n=1], L861Q+S768I [n=1]) and two triple-mutation patterns (L858R+L861Q+G719X [n=1], DEL+L858R+L861Q [n=2]). These comprehensive findings underscore the criticalneed for implementing targeted lung cancer screening programs and routine EGFR mutation testing to guide personalizedtherapeuticstrategies for Algerian patients, whilehighlighting distinct epidemiological patterns and molecular characteristicsthatmayinform future research and public health interventions in NorthAfrican populations.
- ItemRecherche de substances allélopathiques : isolement, caractérisation et applications.(Université Oran1, 2025-10-02)Les métabolites secondaires sont souvent considérés comme étant un moyen de défense de la plante productrice contre divers organismes comme les pathogènes et les ravageurs. La plupart des composés d’origine végétale sont utilisés pour lutter contre les mauvaises herbes afin de réduire l’utilisation des herbicides synthétiques. Le présent travail porte sur la recherche de l'activité allélopathique de différents extraits de trois plantes : Tetraclinis articulata, Peganum harmala et Aloe arboresens sur la germination et la croissance d’une espèce cultivée Lactuca sativa. Les graines ont été mises à germer dans des boites de Petri. L’effet de concentrations croissantes de l’extrait hydrométhanolique (0,25 ; 0,50 ; 0,75 et 1 %) a été testé sur la germination et la croissance. Cette première étape a permis d'identifier le potentiel allélopathique global de chaque espèce. Des effets inhibiteurs d'intensité variable ont été observés sur les graines de L. sativa lors de la germination et la croissance. L’extrait hydrométhanolique de T. articulata présente l'activité d'inhibition la plus importante sur la germination des graines de L. sativa alors que celui de Peganum harmala a un effet inhibiteur sur la croissance des plantules de L. sativa pour toutes les concentrations testées. Parallèlement, la poudre des trois plantes, ajoutée au terreau à différentes concentrations (10%, 30% et 50%) inhibe la croissance des plantules de L. sativa. Les extraits aqueux et hydrométhanoliques testés par pulvérisation foliaire à différentes concentrations 1,5 et 3 % sur les plantules de Lactuca sativa montrent un effet inhibiteur d’intensité variable sur la croissance des plantules de L.sativa Le screening phytochimique par CCM des extraits actifs a révélé la présence d’acides phénoliques, de flavonoïdes et d’alcaloïdes. Le dosage par spectrophotométrie révèle que certains extraits actifs renferment d’importants taux en polyphénols totaux et en flavonoïdes. La caractérisation phytochimique des polyphénols, à l’aide d’une analyse HPLC/MS, a mis en évidence neuf composés phénoliques dont trois flavan-3-ols (pic 1-3) et six flavonols (pic 4-9) pour l’extrait de Tetraclinis articulata. Sept composés non identifiés, et un seul composé identifié dont la catéchine sont mis en évidence dans le cas de l’extrait aqueux de Peganum harmala. Les effets allélopathiques peuvent être d'un intérêt considérable pour le contrôle des mauvaises herbes dans les cultures et ainsi remplacer les produits phytosanitaires néfastes pour l'environnement.