Etude de la biodiversité : Analyse de la variabilité génétique des races ovines algériennes & de leurs relations phylogénétiques par l'utilisation de microsatellites
Etude de la biodiversité : Analyse de la variabilité génétique des races ovines algériennes & de leurs relations phylogénétiques par l'utilisation de microsatellites
| dc.contributor.author | GAOUAR Samir Bachir Souheil | |
| dc.date.accessioned | 2022-11-29T10:14:10Z | |
| dc.date.available | 2022-11-29T10:14:10Z | |
| dc.date.issued | 2009-04-07 | |
| dc.description.abstract | Dans le cadre de l'étude de la biodiversité des ressources génétiques animales en général, et ovines en particulier, nous nous sommes intéressés à trois axes : l'état de cette biodiversité sur le terrain, la variabilité génétique de chacune des races ovines étudiées et les relations phylogénétiques entre elles.Le premier axe a porté sur la répartition géographique actuelle des races ovines, l'ampleur de l'érosion génétique et ses conséquences. L'enquête sur terrain, menée pendant 6 ans environ, nous a permis de remarquer que le cheptel ovin algérien est entrain de subir une homogénéisation génétique sans précédent par les deux races Ouled-Djellal (dans le Tell, la steppe et le Nord du Sahara) et Sidaoun (dans le grand Sud et le Nord du Sahara).Le deuxième axe est basé sur la caractérisation génétique de six races ovines algériennes (D'men, Hamra, Ouled-Djellal, Rembi, Sidaoun et Taâdmit), par l'utilisation de 22 marqueurs microsatellites. La méthode utilisée est l'amplification in vitro des ADN ovins par PCR suivie d'une électrophorèse sur gel de polyacrylamide non dénaturant et coloration froide de l'ADN par le nitrate d'argent pour les 04 marqueurs suivant OarFCB128, OarCP34, INRA63 et BM1824 qui ont été étudiés au niveau de l'USTOMB. Les 18 autres microsatellites : MCM42, OarFCB20, MAF65, INRA49, TGLA53, MCM527, MAF214, CSRD247, HSC, SR-CRSP9, HUJ616, OarFCB304, ILSTS11, OarAE129, OarFCB193, MAF209, OarJMP58 et ILSTS005 ont été génotypés par séquenceur automatique au niveau du laboratoire d'analyses génétiques et vétérinaires (LAGEV), Institut agronomique et vétérinaire Hassan II, Rabat (Maroc) dans le cadre d'un projet de coopération interuniversitaire AUF. Nous avons réalisé l'analyse de l'ensemble des résultats. Ces derniers ont permis la détermination du nombre d'allèles, des taux d'hétérozygotie ainsi que du nombre efficace d'allèles, pour chacune des races étudiées. Un total de 250 allèles différents a été mis en évidence, la race Rembi présentant le plus grand nombre d'allèles (203 allèles dont 19 allèles spécifiques parmi les 66 allèles spécifiques recensés). Des méthodes statistiques ont été utilisées pour l'évaluation de la variabilité génétique intra et inter races.Le troisième axe a porté sur la contribution à l'étude phylogénétique de ces six races ovines par l'analyse des 22 microsatellites analysés. Cette étude a été réalisée en utilisant deux indices de distance génétique : la distance standard de Nei et celle de Reynolds. A partir de ces distances, la construction d'arbres phylogénétiques et l'analyse multidimensionnelle ont été élaborées. Les résultats obtenus ont montré un regroupement des races Ouled Djellal, Rembi et Tâadmit, ce qui est en faveur d'une origine commune de ces races. Les races D'men, Hamra et Sidaoun constitueraient des groupes différents. | |
| dc.format | ||
| dc.identifier.uri | https://dspace.univ-oran1.dz/handle/123456789/1635 | |
| dc.language.iso | fr | |
| dc.publisher | université oran1 Ahmed ben Bella | |
| dc.subject | Variabilité génétique | |
| dc.subject | Microsatellite | |
| dc.subject | Relations phylogénétiques | |
| dc.subject | Races ovines | |
| dc.title | Etude de la biodiversité : Analyse de la variabilité génétique des races ovines algériennes & de leurs relations phylogénétiques par l'utilisation de microsatellites | |
| grade.Co-rapporteur | TABET-AOUL Nacéra, Maître de conférences, Université Oran | |
| grade.Examinateur | AOUES Abdelkader, Professeur, Université Oran | |
| grade.Examinateur | AOUAR Amaria, Maître de conférences, Université de Tlemcen | |
| grade.Examinateur | BOUDJEMAA Abd Allah, Maître de conférences, USTO | |
| grade.Option | BIOLOGIE MOLECULAIRE ET GENETIQUE | |
| grade.Président | FORTAS Zohra, Professeur, Université Oran | |
| grade.Rapporteur | MEHTAR Nadhira, Professeur, USTO | |
| la.Spécialité | Biologie | |
| la.cote | TH2886 |
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