Etude théorique des complexes n : n L-lysine-Eau
Etude théorique des complexes n : n L-lysine-Eau
Fichiers
Date
2007
Auteurs
MELLALI Fatima Zohra Niema
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Éditeur
Résumé
Le but de ce travail s'articule autour de l'étude ; des différentes formes qu'adopte la L-lysine. Celle-ci nous sera utile à mettre en évidence l'influence de l'ionisation de chaque groupement porté par cet acide aminé, sur les paramètres structuraux en l'occurrences, les distances, angles de valence et les angles terme, et en particulier avec l'idée de pouvoir mieux prendre en compte le rôle important que jouent les molécules du solvant du milieu environnement, dans ce cas l'eau, sur les même paramètres structuraux. Ce mémoire s'articule autour de trois chapitres, dont le premier chapitre, à caractère bibliographique, s'organise en deux volets : tout d'abord, nous dresserons un état des connaissances acquise sur les propriétés des protéines et des acides aminés, en s'attachant plus particulièrement aux liaisons qui nous intéressent dans notre étude autres que la liaisons hydrogènes, les liaisons de type ionique, les interactions hydrophobes ou les forces de van der Walls. Outre ces liaisons de faible énergie, on trouve également les ponts disulfures qui aident au repliement de la protéine. Une attention plus particulière sera portée à une étude bibliographique des propriétés structurales et acido-basique de la L-lysine et dérivées dans un deuxième volet. Dans un deuxième chapitre, nous présenterons les méthodes théoriques basées sur des concepts de la chimie informatique permettant l'optimisation de géométrie, soit pour caractériser des minima de l'énergie, soit des états de transition. Le troisième chapitre sera consacré aux différents modèles de salvation des biomolécules, ainsi que la méthode théorique utilisée au cours de ces travaux appliquée aux différents systèmes étudiés. Et nous terminerons par une conclusion.
Description
Mots-clés
L-Lysine; N L-Lysine-Eau; Protéines; Acide Aminé; Liaisons Hydrogènes; Interactions Hydrophobes; Acido-Basique; Energie; Biomolécules; Electrophorèse.